此前，纽大校方表示，该校资金不会介入上海纽约大学。作为美国的一所私立大学，纽大办学经费来源多样，主要以学生学费和附属企业收入为主。学校2008年度财务报告显示，学生学费净收入为118890.7万美元，占学校总收入的59%；附属企业收入为31961万美元，占总收入的16%。换言之，纽大的办学经费基本上是学校自己筹措的。而上海纽约大学的资金预算计划则由三部分构成：浦东新区政府承担校园建设费用，学生学费覆盖学校运营费用，上海市政府承担余下费用。但是最终的协议如何达成，目前还是未知数。
今年年初，常春藤盟校耶鲁大学就在校报《耶鲁日报》中指出，“校长Sexton和David
McLaughlin强调目前还有许多合作问题未解决，尤其是资金预算……耶鲁大学也正筹措在新加坡开设联合学院，最后的决议也盘踞在与新加坡方面的资金预算协议。”
资金预算模式被国外高校视为创办海外分校的一个重要突破口。对学生来讲，办学资金悬而未决，奖学金是否有保障就成为疑问。据国外媒体分析，Sexton原本是美国纽大的法学院院长，在学术圈有良好口碑，在大学管理和筹集资金方面也颇为擅长。他任职纽大法学院期间，曾“挖”来一批名教授，很快使本来排名在20名开外的纽大法学院，跃身为与哈佛、耶鲁媲美的顶级法学院。上海纽约大学成立后，“善于交际”的传奇校长Sexton可能还会扮演吸引企业等社会捐助的角色。因为按照美国高校的办学资金特点，社会捐助可能是上海纽约大学学生奖学金的重要来源。